BAYESIAN GENOMICS (Modelli bayesiani per la genetica)

["Leonardo Bottolo" <lbottolo@eco.unipv.it>]

UNIVERSITA' DEGLI STUDI DI PAVIA
GRUPPO DI STATISTICA PRESSO IL
DIPARTIMENTO DI ECONOMIA POLITICA E METODI QUANTITATIVI

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                           BAYESIAN GENOMICS
                (Modelli bayesiani per la genetica)

                            Chiara Sabatti
        (Departments of Human Genetics and Statistics, UCLA)



 Le scoperte in campo genetico presentano numerose sfide ed opportunità
alla scienza statistica, sia sotto il profilo metodologico che
computazionale.

 Il seminario scientifico, articolato su tre giornate, intende
presentare alcuni strumenti statistici che avranno un ruolo importante
nella ricerca genetica dei prossimi anni, con particolare riferimento
alla modellistica bayesiana.

 Il seminario, organizzato dal gruppo di statistica presso il
Dipartimento di Economia Politica e Metodi Quantitativi, è rivolto a
studiosi di area statistica, genetica, biologica e matematica, con
particolare riguardo a giovani ricercatori e dottorandi.

 Le lezioni si terranno presso la Facoltà di Economia, Via S.Felice,
5 - 27100 Pavia.


                              PROGRAMMA


· Giovedì 20 giugno, ore 10-12 e 14-16, Aula H

  Analisi della sequenza di DNA

  1. Allineamento di più sequenze per identificare porzioni che
     corrispondono ad una funzione biologica simile

  2. Interpretazione del DNA come una successione di parole:
     ricostruzione del dizionario e delle frasi


· Lunedì 24 giugno, ore 10-12 e 14-16, Aula Consiglio di Facoltà

  Analisi di dati sui livelli di espressione dei geni (expression
  microarrays)

  1. Modelli gerarchici

  2. Threshold estimators

  3. False Discovery Rate e modelli bayesiani empirici


· Mercoledì 26 giugno, ore 10-12 e 14-16, Aula Consiglio di Facoltà

  1. Ricostruzione di aplotipi ancestrali e identificazione della
     posizione di un gene

  2. Applicazioni del paradigma di FDR per lo studio dell'associazione
     fra alleli e fenotipi riferiti a loci sparsi nell'intero genoma


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Sito WEB del seminario che include anche i riferimenti bibliografici:
http://economia.unipv.it/eco-pol/semstat/eventi/sabatti.htm

Per ulteriori informazioni sul programma rivolgersi a:
guido.consonni@unipv.it

La partecipazione è gratuita. Si prega tuttavia di confermare la
propria presenza inviando l'adesione all'indirizzo e-mail:
lbottolo@eco.unipv.it

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Comitato organizzatore: Guido Consonni, Leonardo Bottolo e Valentina
Leucari.